Содержание
Микробиологическое исследование мочи на аэробную, анаэробную и грибковую инфекцию с определением чувствительности к расширенному спектру антибиотиков и бактериофагов
Микробиологическое исследование мочи (бактериологическое) — диагностический метод для выделения возбудителя и выявления причин воспалительного процесса мочевыводящих путей, при почечной недостаточности и задержке мочи.
Цель исследования мочи на аэробную, анаэробную и грибковую инфекцию
Врач назначает исследование, цель, которого выделить из образца мочи бактерии и грибки. Идентификация патогенных микроорганизмов позволяет поставить диагноз, и назначить курс лечения.
У человека со здоровыми почками моча стерильна. При прохождении по мочеиспускательному каналу в нее попадает нормальная микрофлора, живущая в уретре, влагалище и на коже промежности.
В норме дистальный отдел уретры населен микроорганизмами: стрептококк, стафилококк, лактобактерии, энтеробактерии и др. Воспалительный процесс в мочевой системе провоцируют:
- Escherichia coli;
- Pseudomonas aeruginosa;
- Citrobacter;
- Proteus mirabilis;
- Klebsiella pneumoniae и др.
Показания для назначения анализа мочи на инфекции
Специфические симптомы — частые позывы к мочеиспусканию, боль при опорожнении мочевого пузыря, в нижнем отделе живота и пояснице.
Неспецифические симптомы (у детей) — снижение аппетита, вялость, повторяющиеся приступы рвоты, раздражительность, повышение температуры.
- Асимптомная бактериурия.
- Подозрение на уроинфекцию.
- Рецидивы инфекции уротракта.
Правила сдачи исследуемого материала
Сбор мочи производят в утренние часы. Используют стерильный контейнер, открывать его непосредственно перед сбором материала. Обязательно хорошо подмываются. Для исследования собирают среднюю мочу (5мл). Отдать ее в максимально короткое время в лабораторию для исследования (до 2 ч).
При помощи катетера берут мочу для определения локализации инфекции. Принудительно опорожняют мочевой пузырь, промывают его с антибиотиком. Собирают порции мочи через 10 минут . При обнаружении бактерий во всех пробах — инфицированы почки, результаты стерильной мочи указывают на инфицирование мочевого пузыря. Достоверный результат обеспечивает надлобковая пункция. Забор мочи проводят до антибактериального лечения или в перерывах между терапией.
Посев взятой мочи
Качественное исследование, для количественного определения клеток микробов (степень бактериурии) в 1 мл мочи. Аэробные посевы производят в чашках Петри с питательными средами. Определяют культуру и оценивают ее чувствительность к антибиотикам и бактериофагам.
Анаэробная инфекция – болезнь, вызываемая облигатными анаэробными бактериями в условиях, благоприятствующих жизнедеятельности этих микробов. Анаэробы могут поражать любые органы и ткани. Облигатные анаэробы разделяются на 2 группы: 1) бактерии, образующие споры (клостридии) и 2) неспорообразующие или неклостридиальные микробы. Первые вызывают клостридиозы, вторые – гнойно-воспалительные заболевания различной локализации. Представители обеих групп бактерий относятся к условнопатогенным микробам.
Неспорообразующие анаэробные бактерии имеющие отношение к заболеваниям человека представлены грамположительными бактериями родов Peptococcus, Peptostreptococcus, Actinomyces; грамнегативными родов Bacteroides, Porphyromonas, Prevotella, Fusobacterium, Veillonella и др. Некоторые виды потенциально способны вызывать патологические процессы, поэтому они называются условнопатогенными. Инфекции, вызываемые анаэробными бактериями, носят эндогенный характер, и их наиболее часто вызывают ассоциации нескольких видов бактерий. Факторы, предрасполагающие к развитию подобных поражений, включают нарушения целостности кожных покровов и СО, травмы, хирургические вмешательства, нарушение правил проведения внутривенных вливаний и т.п.
Род Bactero > Представлен вариабельными по своим размерам палочковидными грам– бактериями. Полиморфны, спор не образуют, облигатные анаэробы, большинство неподвижно, хемоорганотрофы.
Вид B.fragilis является представителем нормальной микрофлорой толстой кишки. В мазках из клинического материала представлены бледными полиморфными палочками с закругленными концами. Как правило, каталаза-положительны. Содержат вакуоли и часто неравномерно окрашиваются по Граму. На кровяном агаре образуют S-формы колонии 1-4 мм в диаметре, серо-белые, прозрачные или мутноватые, негемолизирующие. Рост стимулирует внесение в питательную среду гемина и витамина К. Протеолитические свойства умеренные, лецитиназу не образуют, индол ±. Бактероиды способны расти в присутствии 20% желчных солей.
Патогенез поражений, вызванных бактероидами, включает адгезию к поверхности эпителия и выделение различных продуктов, повреждающих его. B.fragilis секретирует нейраминидазу, гиалуронидазу и фибринолизин. Микроорганизм снабжен капсулой и способен выделять супероксид дисмутазу, защищающие его от вне- и внутриклеточных микробицидных факторов фагоцитов. Все бактероиды содержат эндотоксин, отличающийся по структуре от ЛПС других грамотрицательных бактерий. Бактероиды редко вызывают моноинфекции, гораздо чаще они обусловливают смешанные поражения, вызванные ассоциациями с анаэробными стрептококками, фузобактериями и др. Основные поражения – абсцессы в основном органов брюшной полости.
Лабораторная диагностика. Основной метод бактериологический. Принципы выделения чистой культуры и идентификации аналогичны таковым при подозрении на анаэробную инфекцию.
Лечение. Препараты выбора – левомицетин, метронидазол и имипенем.
Анаэробные грамположительные кокки
Род Peptococcus образуют неподвижные сферические клетки, размером 0,3-1,2 мкм; в мазках располагаются парами, тетрадами, беспорядочными скоплениями или короткими цепочками. Хемоорганотрофы, нуждаются в обогащенных питательных средах. Инертны к углеводам, энергию получают расщеплением пептона. Обычно каталаза-отрицательны, индол–. На кровяном агаре некоторые штаммы формируют черные колонии. Облигатные паразиты слизистых оболочек. Типовой вид Peptococcus niger.
Род Peptostreptococcus образуют неподвижные кокки и коккобациллы размером 0,5-1,2 мкм; морфология и физиология сходны с пептококками, некоторые выделяют индол и восстанавливают нитраты. Типовой вид – Peptostreptococcus anaerobius.
Анаэробные кокки входят в состав микробных сообществ полости рта, верхних отделов дыхательных путей, толстой кишки и влагалища. Патогенные свойства могут быть обусловлены наличием капсулы, действием ЛПС, гиалуронидазы и коллагеназы. Как правило, они не способны вызывать моноинфекции, но их часто выделяют в составе ассоциатов при плевропневмониях, внутрибрюшинных абсцессах, гинекологических поражениях (эндометриты), инфекции кожи и мягких тканей (гангренозные процессы и инфекции трофических поражений у больных сахарным диабетом), при остеомиелитах.
Лабораторная диагностика. Основные методы бактериоскопический и бактериологический.
Лечение. Препараты выбора – клиндамицин, левомицетин, имипенем, а также метронидазол.
Микробиологическое исследование на анализаторе VITEK bioMerieux, позволяющее с более высокой чувствительностью и специфичностью, чем обычный посев, идентифицировать около 200 видов клинически значимых бактерий и подобрать антибиотикотерапию с расчетом минимальной эффективной дозировки препарата. Преимущества исследования по сравнению с обычным посевом: срок выполнения короче на 24 часа; чувствительность определяется к расширенному списку антибиотиков (до 20 шт.); результат выдается как в виде критических значений (чувствителен, умеренно-устойчив, устойчив), так и в виде значений минимальных ингибирующих концентраций антибиотика (МИК). Что, в свою очередь, позволяет выбрать наиболее эффективную минимальную дозу антибиотика, снизив его негативное влияние на человеческий организм. * Чувствительность к антибиотикам будет определена при выявлении патогенных и/или условно-патогенных микроорганизмов. При обнаружении микроорганизмов, составляющих нормальную микрофлору, чувствительность к антибиотикам не определяется, т.к. не имеет диагностического значения.
Бактериологическое исследование клинического материала с определением чувствительности к антибиотикам на анализаторе VITEK bioMerieux; посев на микрофлору в аэробных условиях.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Грудное молоко, мазок из десневого кармана, мазок из зева, мазок с конъюнктивы, мазок из носа, мазок из носоглотки, мазок урогенитальный (с секретом предстательной железы), мокроту, отделяемое уха, рвотные массы, синовиальную жидкость, смыв из бронхов, среднюю порцию утренней мочи, эякулят.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Рекомендуется употребить большой объем жидкости (чистой негазированной воды) за 8-12 часов до сбора мокроты.
- За 3-4 часа до взятия мазков из ротоглотки (зева) не употреблять пищу, не пить, не чистить зубы, не полоскать рот/горло, не жевать жевательную резинку, не курить. За 3-4 часа до взятия мазков из носа не закапывать капли/спреи и не промывать нос. Взятие мазков оптимально выполнять утром, сразу после ночного сна.
- Женщинам исследование (процедуру взятия урогенитального мазка или сбор мочи) рекомендуется производить до менструации или через 2-3 дня после её окончания.
- Мужчинам – не мочиться в течение 3 часов до взятия урогенитального мазка или сбора мочи.
Общая информация об исследовании
Анаэробная микрофлора – это микроорганизмы, для жизнедеятельности и размножения которых не требуется кислород, для многих из них он, наоборот, является губительным. Анаэробы населяют организм человека в норме (в пищеварительном тракте, органах дыхания, мочеполовой системе). При снижении иммунитета или травмах, повреждениях возможна активация инфекции с развитием воспалительного процесса. Организм человека тогда может становиться по сути источником заражения сам для себя (эндогенное инфицирование). Реже анаэробы попадают в организм снаружи (глубокая колотая рана, инфицированный аборт, ранения брюшной и грудной полости, введение спиц и протезов). Развиваясь в толще кожи, мягких тканей и мышц, анаэробные организмы способны вызывать целлюлиты, абсцессы, миозиты. Симптомы, позволяющие заподозрить анаэробную инфекцию мягких тканей: плотный отёк, газообразование (ощущение, что лопаются пузырьки воздуха под кожей при надавливании), гнилостное воспаление, зловонный запах.
Основное лечение анаэробного воспаления – хирургическое. При этом необходимо устранить источник воспаления либо раскрыть рану, обеспечив доступ кислорода, губительного для анаэробов.
Жизнедеятельность аэробной флоры возможна лишь при наличии свободного кислорода. В отличие от анаэробов, у них он участвует в процессе выработки энергии, необходимой им для размножения. Эти бактерии не имеют выраженного ядра. Они размножаются почкованием или делением, при окислении образуя токсичные продукты. Культивирование аэробных бактерий подразумевает не только использование подходящей для них питательной среды, но также и количественный контроль кислородной атмосферы и поддерживание оптимальных температур. Для каждого микроорганизма данной группы существует минимум и максимум кислородной концентрации в среде, окружающей его, необходимой для его нормального размножения и развития.
Факультативные анаэробы – организмы, которые существуют и выполняют все энергетические и репродуктивные циклы по анаэробному пути, но при этом при этом способны существовать и развиваться в присутствии кислорода. Последней характеристикой облигатные и факультативные анаэробы и отличаются, т.к. облигатные не способны существовать в условиях кислорода и при его появлении гибнут. Всю необходимую для своего существования, развития и размножения энергию факультативные анаэробы получают с помощью расщепления органических и неорганических соединений.
Для дифференциальной диагностики анаэробной и аэробной инфекции проводят посев биоматериала на флору, так как принципы лечения в том или ином случае будут разные. По выросшей культуре определяется вид микроорганизмов, которые участвуют в формировании воспалительной реакции. Зная вид возбудителя, можно подобрать антибактериальный препарат, который способен успешно влиять на данные микроорганизмы.
В ходе данного исследования определяется наличие аэробной и факультативно-анаэробной флоры.
Микробиологическое исследование на анализаторе VITEK bioMerieux позволяет с более высокой чувствительностью и специфичностью, чем обычный посев, идентифицировать около 200 видов клинически значимых бактерий и подобрать антибиотикотерапию с расчетом минимальной эффективной дозировки препарата. Система анализатора предназначена для идентификации грамотрицательных палочек, грамположительных кокков, анаэробных бактерий, нейссерий, гемофильных палочек, других прихотливых бактерий, коринбактерий, лактобактерий, бацилл, грибов (более 450 таксонов). Система анализатора состоит из анализатора бактериологического и персонального компьютера. Автоматизация процесса снижает риск контаминации материала и ошибок в результатах исследования.
После выявления культуры бактерий целесообразно провести определение их чувствительности к разным антибиотикам. Зная вид возбудителя, можно подобрать антибактериальный препарат, который способен успешно влиять на данные микроорганизмы. В связи с тем что все чаще наблюдается развитие антибиотикорезистентности микроорганизмов, подбор антибиотиков по их спектру действия на бактерии может привести к малоэффективному или вообще безрезультатному лечению. Преимуществом метода определения чувствительности к антибиотикам является точное определение антибактериального препарата, имеющего наивысшую эффективность в конкретном случае.
Для чего используется исследование?
- Дифференциальная диагностика анаэробной и аэробной инфекций, подбор адекватного терапевтического лечения с учетом обнаруженной микрофлоры.
- Диагностика латентных, скрытых и хронических инфекций: обнаружение персистирующих, труднокультивируемых и/или некультивируемых форм микроорганизмов.
- Для выбора антибиотика для успешного лечения инфекции.
Когда назначается исследование?
- При различных патологиях воспалительно-инфекционного генеза – для своевременной, быстрой идентификации возможного возбудителя.
- При симптомах, позволяющих заподозрить анаэробную инфекцию (газообразование, гнилостное воспаление).
Что означают результаты?
Причина выявления микроорганизмов – присутствие роста колоний данного вида микроорганизмов на питательной среде (при этом данная микрофлора может быть нормальной: Streptococcus mitis, Neisseria mucosa, Staphylococcus aureus, Streptococcus viridans group).
Данное исследование не предусматривает выделение анаэробной микрофлоры, вирусов, хламидий, а также микроорганизмов, требующих особых условий культивирования, таких как Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis, Corynebacterium diphtheriae, Mycoplasma spp, Ureaplasma spp, Mycobacterium tuberculosis. При отсутствии роста диагностически значимой микрофлоры при бактериологическом посеве и наличии клинической картины рекомендуется назначение дополнительных исследований.
Кто назначает исследование?
Инфекционист, терапевт, гинеколог, врач общей практики, оториноларинголог, педиатр.
Литература
- Fermin A Carranza, Paulo M. Camargo. The Periodontal Pocket. / Carranza’s Clinical Periodontology, 2012, 127-139.
- Mirela Kolakovic, Ulrike Held, Patrick R Schmidlin, Philipp Sahrmann. An estimate of pocket closure and avoided needs of surgery after scaling and root planing with systemic antibiotics: a systematic review. / BMC Oral Health. 2014; 14: 159.